故事讲述2017年，“The World”的续作“The World R:2”席卷世界，而由于设计缺陷而使R:2变成了无法无天的PK地带，而这部《.hack//G.U.TRILOGY》就是讲述发生在已变质的R:2世界里的悲剧故事。动画化阵容基本沿袭游戏阵容，原作游戏总指挥松山洋将担任动画监督